Acteur mondial du diagnostic in vitro depuis plus de 40 ans, bioMérieux conçoit, développe, produit et commercialise des réactifs et des instruments automatisés destinés aux analyses médicales et au contrôle microbiologique industriel. Présent dans plus de 150 pays au travers de 35 filiales et d'un large réseau de distributeurs, bioMérieux emploie 5 700 personnes dans le monde et réalise un chiffre d'affaires d'environ 1 milliard d'Euros dont 83 % à l'international.
Nous proposons pour notre site de Grenoble un :

Stage Bio-Informatique de 6 mois

Rattaché(e) à la Direction Recherche et Développement (IT) au sein de l'équipe Bio-Informatique, vous travaillerez sur un projet de biologie moléculaire. L'objectif du stage est d'élaborer un modèle évolutif permettant d'améliorer les choix de design d'amorces et de sondes pour les kits de détection et quantification en prenant comme modèle le virus HIV.

Dans le cadre des activités des programmes de développement NucliSENS, les activités principales de ce stage sont :
- Un travail bibliographique (état de l'art)
- Collecter les séquences HIV des banques publiques (deux DB devront être constituées : Périmètre Externe et Périmètre Interne). S'assurer de la qualité des données recueillies.
- Développer des indices permettant de décrire et visualiser les données sur le polymorphisme le long du génome viral. Ceci en incluant la distinction entre PI et PE
- Concevoir un modèle évolutif permettant de prédire les futures probabilités de polymorphisme le long de la séquence.
- Rédiger les livrables détaillant les méthodes et workflows utilisés (en plus du rapport de stage).
- Implémenter la méthode (stade de prototype) et documenter l'implémentation.

De formation minimum bac+5 sur les trois domaines, biologie, informatique et statistiques, vous êtes attiré(e) par la bio-informatique et la biologie évolutive. A l'aise en anglais vous possédez une bonne culture scientifique générale et savez faire preuve d'une excellente capacité d'écoute et de synthèse.

Connaissances spécifiques :
- biologie : biologie moléculaire, génétique, biologie évolutive, génétique des populations
- fonctionnement des algorithmes classiques de bio-informatique (BLAST, Clustal, MUSCLE...), utilisation des banques de données publiques, connaissance d'un logiciel de statistique (R ou équivalent)
- mathématiques : statistiques (test paramétrique, non paramétrique, analyses multivariées...), modélisation...

Merci d'adresser un dossier complet (Lettre, CV)
par e-mail :
xavier.gansel@eu.biomerieux.com

ou par courrier à :
X. Gansel
bioMérieux
5 rue des Berges
Xavier Gansel
38000 GRENOBLE

xavier.gansel@eu.biomerieux.com