Recherche candidat(e) pour un stage de master (M2) en Bioinformatique
L’Unité de recherche Expression des Gènes et Régulation Epigénétique par l'Aliment
(EGEAL) de l’Institut Polytechnique Lasalle à Beauvais (www.lasalle-beauvais.fr) recherche
un(e) candidat(e) pour un stage de master (M2) en bioinformatique à partir de Janvier 2010


Sujet proposé: Analyse et validation des modèles de réseaux biologiques à partir des
données cliniques du métabolisme des monocarbones
La biologie des systèmes (BS) est une discipline émergente qui se situe à l’interface des
mathématiques, de l’informatique et de la biologie (bioinformatique), vise à intégrer différents niveaux
de description des systèmes biologiques pour comprendre le fonctionnement et les propriétés des
organismes. Sa méthodologie originale est définie par un aller-retour dynamique entre théories
mathématiques, l’informatique, l’expérimentation pour la formulation de nouvelles hypothèses
scientifiques. Nous travaillons sur des méthodes permettant d'analyser les systèmes biologiques par
simulation (in silico), par exploration (checking), ou par apprentissage sur les données (learning) afin
de prédire et étudier les relations entre les réseaux métaboliques ou génétiques et le déterminisme des
phénotypes.
Le stage proposé porte sur l’exploitation des données expérimentales du réseau métabolique et
génétique des monocarbones. Le candidat retenu procèdera : à l'analyse statistique de ces données
par apprentissage et à l'étude critique d'une démarche de validation d’un modèle de réseau
biologique. Il sera amené à coupler les données expérimentales avec des méthodes formelles de
modélisation.

Compétences souhaités
- Connaissances en modélisation bioinformatique
- Notions de statistiques
- Expérience dans l'utilisation des logiciels et bases de données bioinformatiques
- connaissances en biochimie ou en biologie
- Bon sens relationnel.

Durée: 6 mois rémunéré
Pour toute candidature, envoyer Cv + lettre de motivation:
Abalo CHANGO (Abalo.Chango@lasalle-beauvais.fr

Abalo.Chango@lasalle-beauvais.fr