Recherche et étude de Non-Ribosomal peptide Synthetases (NRPS) via une approche métagénomique.


Sujet :

Parmi les antibiotiques, il existe des peptides particuliers dont la synthèse par les micro-organismes ne suit pas la voie classique dite "ribosomale". Ces peptides sont synthétisés par des complexes multienzymatiques appelés « NonRibosomal Peptide Synthetases » NRPS. Ces NRPS permettent la production d’une grande diversité de peptides incorporant des acides aminés rares. Ces peptides sont linéaires ou cycliques et peuvent porter des chaînes carbonées (acide gras) qui leurs permettent de pénétrer à l’intérieur des membranes biologiques.
Des systèmes NRPS ont été décrits chez de nombreux micro-organismes (Bacillus, Streptomyces) et sont impliqués dans la production de molécules comme la tyrocidine, la gramicidine, la vancomycine, et la pénicilline.


Des études récentes ont permis de démontrer que les environnements maritimes et côtiers pouvaient constituer des niches de choix pour la recherche de micro-organismes utilisant ces systèmes NRPS. Cependant, ces micro-organismes restent majoritairement non cultivables.

Le projet vise à identifier et caractériser des systèmes génétiques de type NRPS chez des micro-organismes issus de niches côtières. L’approche envisagée repose sur des méthodes non-culturales, via la construction et le criblage (PCR, hybridation moléculaire) de banques métagénomiques.

Résultats attendus : identification de gènes impliqués dans la production de peptides d’intérêt.



Compétences techniques :
Biologie moléculaire (PCR, RT-PCR, clonage, construction de banques)
Microbiologie (culture bactérienne, mesure d’activité antibactérienne)

UMR CNRS 6250 LIENSs

Adresse : Université de La Rochelle UFR Sciences LIENSs UMR6250
17000 LA ROCHELLE
Web :

Mr Mr Chevrot
stage.microbio.lienss@gmail.com

lienss.univ-larochelle.fr/