Proposition de stage : étude de l'expression du gène codant l'endothelin 1 chez
Offre de stage n° 6972 du 05/09/2006
Déposée par
Département Génie Biologique (Le réseau des Génie Bio Saint-Brieuc)
Diplôme concerné
DUT
Contrat
Intérim
Localisation
BRETAGNE / Finistère PLOUZANE
Description
Laboratoire : IFREMER, UMR-1067 NUAGE, BP 70, 29 280 Plouzané.
Equipe : Adaptation Reproduction et Nutrition des poissons, Responsable : V. Buchet
Coordonnées du responsable du stage : D. Mazurais, chercheur IFREMER , Tél : 02 98 22 44 87 email : dmazurai@ifremer.fr
Sujet : Etude de l’expression du gène codant l’endothelin 1 chez la larve de bar
Résumé : Notre équipe "Adaptation Reproduction et Nutrition des poissons" étudie depuis plusieurs années le développement et la maturation de la larve de bar en rapport avec son alimentation. Notre activité de recherche a pour objectif l’acquisition de connaissances fondamentales et appliquées nécessaires à l’amélioration des conditions d’élevages et notamment des régimes alimentaires dispensés au stade larvaire. Un des volets de notre activité consiste à rechercher les acteurs et mécanismes moléculaires impliqués dans la genèse des malformations induites par une alimentation inadaptée (carence ou surdosage vitaminique) chez la larve de bar. Dans ce contexte, le sujet de stage proposé visera la caractérisation (par RT-PCR en temps réel et/ou par hybridation in toto) des profils d’expression du gène codant l’endothelin 1 (EDN1) au cours du développement de la larve de bar soumise à un régime alimentaire dont les effets tératogènes ont été caractérisés au laboratoire (malformations crâniennes et vertébrales). Des études réalisées chez les vertébrés indiquent que EDN1 intervient notamment dans le développement des structures cranio-faciales. Chez le poisson-zèbre, il a notamment été montré que des malformations de la mâchoire inférieure s’accompagnent d’une perturbation de l’expression de ce gène. Par ailleurs, des études in vitro indiquent que l’expression d’EDN1 peut être régulée de façon dose-dépendante par l’acide rétinoïque (métabolite actif de la vitamine A). EDN1 représente donc un candidat idéal dans le cadre de l’étude des mécanismes moléculaires sous tendant le développement de malformations d’origine alimentaire chez la larve de bar.
Approches et matériel utilisés: 1/ extraction et purification d’ARN de larve de bar, RT-PCR en temps réel. 2/ synthèse de sonde ARN marquée à la digoxigénine et hybridation sur tissu fixé
Domaines de compétences souhaités : Intérêts pour la biologie moléculaire
Offre n° 7547